17/06/1994: Ο Μίκης υποβάλλει την παραίτηση του από τη θέση του Γενικού Διευθυντή Μουσικών Συνόλων της ΕΡΤ. “Πραγματοποιήσαμε κάτι τόσο θαυμάσιο. Είχαμε στήσει έναν χώρο που έμοιαζε με μελίσσι, αλλά όλα αυτά, πάει, τέλειωσαν τώρα”, λέει σχολιάζοντας αναδρομικά τη θητεία του ως μουσικός διευθυντής της ΕΡΤ. Ως κύριο επιχείρημα για την παραίτησή του ο Θεοδωράκης πρόβαλε, τον “μπερλουσκονισμό”, τον ασφυκτικό έλεγχο γνωστών μεγαλοεκδοτών στο μουσικό γίγνεσθαι του τόπου.
Απερίσπαστος πλέον θα αφοσιωθεί στη μουσική δημιουργία (1995) συνθέτοντας Λυρικές Τραγωδίες όπως η «Μήδεια», η «Ηλέκτρα», η «Αντιγόνη» και θα περιοδεύσει όλο τον κόσμο σε συναυλίες, με έργα συμφωνικά, μετασυμφωνικά αλλά και με τραγούδια.
Από τις μεγάλες στιγμές με τα Μουσικά Σύνολα της ΕΡΤ επιλέγομε μια συναυλία του 1994 από το Μέγαρο Μουσικής Αθηνών με τα έργα του Μίκη Θεοδωράκη «Χαιρετισμοί», σε στίχους Γιάννη Θεοδωράκη, Αγγελικής Ελευθερίου και «Μυθιστόρημα» σε ποίηση Γιώργου Σεφέρη. Τραγουδούν η Δήμητρα Γαλάνη και η Μαρία Φαραντούρη και διευθύνει ο ίδιος.